Laserska konfokalna mikroskopija koristi lasersko svjetlo kao izvor svjetla
Tradicionalni optički mikroskop koristi izvor svjetlosti polja, a sliku svake točke na uzorku ometat će difrakcija ili raspršena svjetlost susjednih točaka; laserski konfokalni mikroskop koristi lasersku zraku za formiranje točkastog izvora svjetlosti kroz rupicu za osvjetljavanje za skeniranje svake točke žarišne ravnine uzorka, a ozračena točka na uzorku slika se na rupici za otkrivanje, koja se prima točku po točku ili liniju po točku ili liniju pored cijevi za umnožavanje točaka (PMT) ili hladno spojenog uređaja (cCCD) iza detekcijske rupice i brzo oblikuje fluorescentnu sliku na zaslonu monitora računala. Rupica za osvjetljavanje i rupica za otkrivanje konjugirane su u odnosu na žarišnu ravninu leće objektiva. Točke na žarišnoj ravnini fokusiraju se na osvjetljavajuću rupicu i emitirajuću rupicu u isto vrijeme. Točke izvan žarišne ravnine neće biti prikazane na rupici za otkrivanje. Ovako dobivena konfokalna slika je optički presjek uzorka, čime su prevladani nedostaci uobičajenog zamućenja mikroskopske slike.
Laserski konfokalni mikroskop skup je sustava za promatranje, analizu i izlaz koji koristi laser kao izvor svjetlosti, usvaja princip konjugiranog fokusiranja i uređaj na temelju tradicionalnog optičkog mikroskopa i koristi računalo za obradu digitalne slike promatranog objekta. Razlučivost optičkog oslikavanja povećava se za 30 posto ~ 40 posto, a ultraljubičasto ili vidljivo svjetlo koristi se za pobuđivanje fluorescentnih sondi za dobivanje fluorescentnih slika finih struktura unutar stanica ili tkiva te za promatranje fizioloških signala i promjena u staničnoj morfologiji na substaničnom razini, postavši nova generacija istraživačkih alata u poljima morfologije, molekularne biologije, neuroznanosti, farmakologije, genetike itd.
