1. Različiti izvori rasvjete
Izvor osvjetljenja koji se koristi u mikroskopu je protok elektrona koji emitira elektronski top, a izvor osvjetljenja optičkog mikroskopa je vidljiva svjetlost (sunčeva svjetlost ili svjetlost). Budući da je valna duljina podtoka mnogo kraća od valne duljine svjetlosnog vala, povećanje i razlučivost elektronskog mikroskopa znatno su veći od svjetlosnog zrcala. .
2. Različite leće
Objektiv koji povećava u elektronskom mikroskopu je elektromagnetska leća (elektromagnetska zavojnica u obliku prstena koja može generirati magnetsko polje u središtu), a objektiv optičkog mikroskopa je optička leća izrađena od stakla. Postoje tri skupine elektromagnetskih leća u elektronskim mikroskopima, koje su ekvivalentne funkcijama kondenzatorskog objektiva i okulara u optičkim mikroskopima.
3. Različiti principi snimanja
U elektronskom mikroskopu, snop elektrona koji djeluje na uzorak koji se ispituje povećava se pomoću elektromagnetske leće i zatim udara u fluorescentni zaslon za snimanje ili djeluje na fotoosjetljivi film za snimanje. Mehanizam razlike u gustoći elektrona je taj da kada snop elektrona djeluje na uzorak koji se ispituje, upadni elektroni se sudaraju s atomima tvari i generiraju raspršenje, a različiti dijelovi uzorka imaju različite stupnjeve raspršenja za elektrone, pa se elektronska slika uzorka prikazuje u nijansama. Slika objekta uzorka u optičkom mikroskopu prikazuje se s razlikom u svjetlini, koja je uzrokovana razlikom u količini svjetlosti koju apsorbiraju različite strukture uzorka.
4. Razlučivost
Zbog interferencije i difrakcije svjetlosti, razlučivost optičkih mikroskopa može se ograničiti samo na 02-05um. Budući da elektronski mikroskopi koriste elektronske zrake kao izvore svjetlosti, stopa kvara može doseći između 1 i 3 nm. Stoga promatranje tkiva optičkim mikroskopima pripada analizi na mikronskoj razini, a promatranje tkiva elektronskim mikroskopima pripada analizi na nano razini.
5. Dubina polja
Općenito, dubina polja optičkog mikroskopa je između 2-3um, pa je glatkoća površine uzorka iznimno zahtjevna, pa je postupak pripreme uzorka relativno kompliciran. Duh SEM može biti visok i do nekoliko metara, tako da nema zahtjeva za glatkoću geometrije površine uzorka, priprema uzorka je relativno jednostavna, a neke geometrije uzorka ne zahtijevaju pripremu uzorka. Stereo mikroskopi imaju relativno veliku dubinsku oštrinu, ali im je rezolucija vrlo niska.
6. Koriste se različite metode pripreme uzoraka
Postupak pripreme uzoraka tkiva i stanica koji se koriste za submikroskopsko promatranje je složen, s velikim tehničkim poteškoćama i troškovima. Posebni reagensi i postupci potrebni su u koracima uzorkovanja, fiksacije, dehidracije i ugradnje. Na kraju, ugrađene blokove tkiva potrebno je staviti u ultramikrotom za rezanje na ultratanke uzorke debljine od 50 ~ 100 nm. Uzorci promatrani svjetlosnim mikroskopom općenito se stavljaju na stakalce, kao što su uzorci običnih rezova tkiva, uzorci razmaza stanica, uzorci pritisnuti tkivom i uzorci kapljica stanica.
7. Povećanje
Efektivno povećanje optičkog mikroskopa je 1000X. Učinkovito povećanje dobrog električnog mikroskopa može doseći 1000 000X.
