Mikroskopi omogućuju znanstvenicima promatranje i proučavanje objekata koje ljudsko oko ne može otkriti. Dvije metode promatranja mikroorganizama su svjetlosna mikroskopija i elektronska mikroskopija. Optička mikroskopija koristi vidljivu svjetlost za izlaganje mikroorganizama. To je donekle nepovoljno jer elektronski mikroskopi zahtijevaju vakuum za ispitivanje uzoraka. Prijenosni i pristupačni svjetlosni mikroskopi omogućuju istraživačima promatranje živih organizama. Ali optički mikroskopi imaju i svoje nedostatke.
povećati
Povećanje optičkog mikroskopa je oko 2000 puta, a ne može povećati kao elektronski mikroskop. Relativno velike valne duljine svjetlosti smanjuju snagu povećanja optičkog mikroskopa jer su male sferne leće potrebne za fokusiranje i širenje svjetlosti.
Rezolucija
Optički mikroskopi imaju manju rezoluciju. Kako se lomljeni svjetlosni valovi šire, rezultirajuća slika je zamućena. Čak i instrumenti koji imaju dodatne leće za povećanje povećanja malo poboljšavaju rezoluciju slike.
promatrati unutarnju strukturu
Teško je promatrati unutarnju strukturu živih bića bez upotrebe boja. Živi uzorci moraju biti ubijeni i fiksirani tijekom bojenja, čime se eliminiraju uobičajene prednosti svjetlosne mikroskopije.





